Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc185Q3V118 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms