Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3V0E1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3V0E1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms