Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmat1Q3V0C1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms