Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E330034G19RikQ3UWX6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E330034G19RikQ3UWX6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms