Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb2Q3UUV9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-Eb2Q3UUV9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms