Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrc4Q3UP24 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrc4Q3UP24 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrc4Q3UP24 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrc4Q3UP24 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrc4Q3UP24 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms