Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdgfl2Q3UMU9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms