Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrch2Q3UMG5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lrch2Q3UMG5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms