Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lsg1Q3UM18 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsg1Q3UM18 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms