Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam83fQ3UKU4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam83fQ3UKU4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms