Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pcgf5Q3UK78 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcgf5Q3UK78 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms