Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gpr55Q3UJF0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms