Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx27Q3UHD6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms