Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtpbp6Q3U6U5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms