Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms