Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pag1Q3U1F9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms