Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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