Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTA7

Cblb, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CblbQ3TTA7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CblbQ3TTA7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CblbQ3TTA7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms