Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q3TQQ9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q3TQQ9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms