Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctdnep1Q3TP92 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms