Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gdpgp1Q3TLS3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms