Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RubcnlQ3TD16 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RubcnlQ3TD16 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms