Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hddc2Q3SXD3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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