Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdss1Q33DR2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdss1Q33DR2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms