Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim71Q1PSW8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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