Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd300lgQ1ERP8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms