Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo3bQ1EG27 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Myo3bQ1EG27 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms