Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CPSF1Q10570 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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