Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms