Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q08AU9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q08AU9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Q08AU9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q08AU9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q08AU9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q08AU9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms