Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms