Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou6f1Q07916 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms