Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col17a1Q07563 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms