Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gdf9Q07105 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf9Q07105 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf9Q07105 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf9Q07105 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf9Q07105 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf9Q07105 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf9Q07105 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gdf9Q07105 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms