Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdr16c6Q05A13 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdr16c6Q05A13 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms