Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col9a1Q05722 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms