Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Apoc2Q05020 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms