Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kcnb1Q03717 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kcnb1Q03717 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms