Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms