Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ddr1Q03146 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms