Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GscQ02591 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GscQ02591 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GscQ02591 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GscQ02591 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GscQ02591 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GscQ02591 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GscQ02591 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GscQ02591 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GscQ02591 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GscQ02591 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GscQ02591 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GscQ02591 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GscQ02591 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GscQ02591 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GscQ02591 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GscQ02591 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GscQ02591 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GscQ02591 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms