Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Snai1Q02085 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms