Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RykQ01887 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RykQ01887 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RykQ01887 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RykQ01887 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RykQ01887 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RykQ01887 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RykQ01887 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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RykQ01887 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RykQ01887 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RykQ01887 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RykQ01887 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RykQ01887 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RykQ01887 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RykQ01887 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RykQ01887 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RykQ01887 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RykQ01887 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RykQ01887 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RykQ01887 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RykQ01887 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RykQ01887 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RykQ01887 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RykQ01887 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RykQ01887 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RykQ01887 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RykQ01887 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RykQ01887 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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