Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VcpQ01853 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms