Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms