Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mc1rQ01727 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms