Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Top2aQ01320 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms