Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelpQ01102 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms