Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbp4Q00724 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbp4Q00724 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms