Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabpb1Q00420 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms